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Actualités Analyse d'oignon 2018

Le génome de l'oignon n'a pas livré tous ses secrets

19 Novembre 2018 -Niels van der Boom

Afin de mettre plus rapidement de nouvelles variétés sur le marché, des chercheurs de l'Université et de la recherche de Wageningen (WUR) ont commencé à cartographier le génome de l'oignon il y a des années. Une grande partie est maintenant cartographiée, mais de nombreuses recherches sont encore nécessaires avant que les effets ne soient perceptibles.

En 2015, vous avez présenté la première version du génome de l'oignon. Comment ça se passe 3 ans plus tard ?
"Déterminer une séquence du génome, c'est cartographier l'ADN. La version de 2015 était composée de petits morceaux qui formaient ensemble le génome de l'oignon. On ne savait pas encore à l'époque quels morceaux appartenaient ensemble et dans quel ordre", explique Olga Scholten, chercheuse à Wageningen. Recherche sur les plantes.

Richard Finkers, chercheur à Wageningen Plant Research, ajoute : « Nous avons pris des mesures pour organiser ces pièces dans l'ordre. Cela est possible car il y a de grandes et de petites pièces, qui se chevauchent partiellement. De cette façon, le puzzle est encore résolu. Nous avons a également franchi une étape dans la localisation des gènes dans le génome. Nous avons maintenant pu attribuer une fonction à certains de ces gènes.

Cela devrait conduire à une sélection plus rapide de nouvelles variétés. Est-ce déjà pratique ?
Scholten : « La sélection d'une nouvelle variété prend 14 ans et cette période peut être encore plus longue. En raison de la planification requise pour la sélection, il est trop tôt pour dire quoi que ce soit à ce sujet. et les chercheurs, les connaissances deviennent disponibles. Cela conduit à une approche différente de la sélection, dans laquelle un plus grand nombre (après croisement) sera testé pour la présence de certains gènes ou de combinaisons de ceux-ci.

Le génome de l'oignon est 16 fois plus grand que celui de la tomate

-Richard Finkers

Les producteurs ont-ils commencé à travailler avec des informations que vous avez démêlées ?
"Bejo et De Groot en Slot ont financé le projet, en collaboration avec Genome Scan et le secteur supérieur de l'horticulture et des matériaux de propagation. Lorsque Bejo a décidé de faire cela, c'était excitant de voir jusqu'où nous pouvions aller avec la séquence. Le génome de l'oignon est très grand : 16 fois plus grand que le génome de la tomate. L'obtention de données n'est pas le goulot d'étranglement, mais l'analyse est une autre histoire. Après la publication du génome de l'oignon, d'autres chercheurs commenceront à utiliser les possibilités offertes par le séquençage du génome », déclare Finkers.

À quels défis serez-vous confrontés dans les 3 prochaines années et au-delà ?
"Rassembler efficacement les informations est un défi. Dans nos recherches, il est prioritaire de rendre ce processus plus efficace, afin que nous puissions prendre les meilleures décisions possibles dans le processus de sélection", déclare Finkers.

Scholten ajoute : « De plus, il est important que nous commencions à utiliser le génome, par exemple pour comprendre la résistance aux maladies et aux ravageurs, mais aussi pour rendre les oignons plus tolérants à la sécheresse. C'était un problème majeur cette année et on s'attend à ce qu'il se produise. plus fréquemment dans les années à venir. Quels gènes jouent un rôle dans ces processus, que pouvons-nous apprendre des autres cultures et comment pouvons-nous traduire ces connaissances en oignons ? »

Finkers conclut : « Le rôle de pouvoir faire bon usage de l'information est de plus en plus reconnu comme important. Le génome de l'oignon n'a pas encore livré tous ses secrets. Nous espérons pouvoir faire de grands progrès.

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Niels van der Boom

Niels van der Boom est rédacteur en chef chez arable Boerenbusiness. Il rapporte principalement sur le marché de la pomme de terre. Il présente chaque semaine le point sur le marché des pommes de terre.
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